日本国内において、龍脈の結節点に置かれた巨大な要石としての役割を担う特殊な学術研究都市。表向きには「医学・薬学に特化した研究開発を実施するための国家プロジェクト」「国内外から投資を呼び込むための官民ファンド」のような喧伝がされており、実際にその名の通り医学・薬学関連の大学や研究機関、企業などが軒を連ねている。 現在医学特区は全国六か所に設置されており、このうち最大の面積と規模を誇る医学特区がいとしま医学特区である。いずれも六角形の逆錐型の人工島で、海底部に水天龍宮という神社を構えている。
先進技術によって引き起こされる犯罪を取り締まるという建前の元、魔術、幻想、神秘などを管理・監視、事件の捜査と事件の秘匿をする役割を担う。
『レゾン・デートル』作中において、市ノ瀬咲良、大河カレン両名が所属する組織。内部組織に螺旋捜査部、螺旋監査部の二つがあり、主に実働は螺旋捜査部所属の螺旋捜査官たちが、お役所仕事や国家機密に関わるような事案に関しては螺旋監査部所属の螺旋監察官が担っている。
基本的に拠点は日本国内に六ケ所存在する学術研究都市「医学特区」に置かれており、必要となった際に任務を言い渡される。麻薬取締部に業態が近い。
表向きには存在しない省庁。秘匿された組織であり、日本政府が保有する魔術的自衛戦力。ここに所属する職員は国家陰陽師と呼称される。
所属しているのは魔術師・呪術師のみ。公安局が対応できない重大神秘案件に介入する。ここに所属する職員は適性に応じて様々な儀装身分を付与されている。人によっては宮内庁勤めということになっている者もおり、場合によっては皇居での行事に参加することもある。
欧州に存在する、ヴァチカン神秘管理局を中心とした神秘秘匿機関。世界最大の魔術結社。基本的なスタンスとしては「幻想種・神秘生命の管理・監督、現実社会に悪影響を及ぼす幻想種・神秘生命の征伐」が掲げられている。
また内部組織として学術部と呼ばれる魔術師の養成機関、魔術研究機関を保有しており、昼夜を問わず馬子の背骨に触れ、真理を追い求める者たちが存在している。